Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
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