Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HTR4Q13639 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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