Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDH18Q13634 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDH18Q13634 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms