Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2Q13563 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms