Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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