Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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