Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SCGB2A2Q13296 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SCGB2A2Q13296 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SCGB2A2Q13296 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SCGB2A2Q13296 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SCGB2A2Q13296 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SCGB2A2Q13296 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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