Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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