Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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NR1H3Q13133 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR1H3Q13133 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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