Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHAF1BQ13112 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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