Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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