Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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