Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms