Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms