Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms