Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX2Q04743 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms