Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms