Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms