Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms