Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDM2Q00987 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms