Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms