Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PKD1P98161 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKD1P98161 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PKD1P98161 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PKD1P98161 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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