Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRX6P78412 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX6P78412 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms