Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB4BP68371 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms