Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms