Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HERVK_113P61574 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms