Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms