Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP4P57796 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP4P57796 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms