Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EEFSECP57772 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms