Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms