Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASP9P55211 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms