Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUCLG1P53597 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SUCLG1P53597 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms