Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERFP50548 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERFP50548 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERFP50548 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms