Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP153P49790 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP153P49790 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP153P49790 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP153P49790 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms