Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSEN1P49768 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms