Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PXNP49023 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PXNP49023 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PXNP49023 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PXNP49023 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms