Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIP4K2AP48426 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIP4K2AP48426 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms