Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC6A9P48067 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms