Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms