Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTGDSP41222 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms