Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA1P35221 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms