Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTX2P32243 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms