Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRB3P28472 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms