Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMA4P25789 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms