Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms