Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms