Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CXCL2P19875 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms