Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN1P18031 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN1P18031 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms