Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DESP17661 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DESP17661 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms