Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms